MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy

Total Repeats: 7047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020549	GTA	2	6	9	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020549	ATAG	2	8	32	39	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020549	AACG	2	8	69	76	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020549	GA	3	6	98	103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020549	TTA	2	6	108	113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020549	AAT	2	6	146	151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020549	CGA	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020549	AAG	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020549	AG	3	6	192	197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020549	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020549	TCT	2	6	264	269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020549	AAAAT	2	10	277	286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020549	T	7	7	322	328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020549	GAAAA	2	10	346	355	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020549	GAA	2	6	399	404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020549	CTT	2	6	415	420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020549	AT	3	6	447	452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020549	GGA	2	6	543	548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020549	TGC	2	6	578	583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020549	TTC	2	6	596	601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020549	ATT	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020549	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020549	T	6	6	723	728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020549	TCA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020549	CAAG	2	8	1010	1017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020549	GCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020549	GCTCCT	2	12	1029	1040	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020549	CTA	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020549	CCG	2	6	1117	1122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020549	ATC	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020549	A	6	6	1143	1148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020549	TC	3	6	1175	1180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020549	TCT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020549	CAA	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020549	AAT	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020549	TTCC	2	8	1339	1346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020549	CAG	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020549	ACC	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_020549	GCT	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020549	ATC	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020549	GA	3	6	1512	1517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020549	TGA	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020549	TAAA	2	8	1600	1607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020549	CTT	2	6	1615	1620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020549	T	6	6	1641	1646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020549	T	6	6	1654	1659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020549	AT	3	6	1693	1698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020549	AAT	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020549	AGA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020549	AT	3	6	1785	1790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020549	A	6	6	1810	1815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020549	TA	3	6	1819	1824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020549	A	6	6	1906	1911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020549	CAA	2	6	5237	5242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020549	ATGG	2	8	5244	5251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020549	T	8	8	5931	5938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020549	A	6	6	5971	5976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020549	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020549	A	7	7	5985	5991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020549	TAA	2	6	6020	6025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020549	AAAC	2	8	6026	6033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020549	ATT	2	6	6045	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020549	A	7	7	6065	6071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020549	A	6	6	6080	6085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020549	TCA	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020549	A	7	7	6115	6121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020549	TA	4	8	6122	6129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020549	AAT	2	6	6141	6146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020549	AT	3	6	6165	6170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020549	CAT	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020549	TAC	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020549	AT	3	6	6224	6229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020549	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020549	TAA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020549	TAC	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020549	TGA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020549	TCA	2	6	6329	6334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020549	ATA	2	6	6355	6360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020549	TC	3	6	10636	10641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020549	A	6	6	10665	10670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020549	A	6	6	10672	10677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020549	TTCT	2	8	10678	10685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020549	T	7	7	14903	14909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020549	GAA	3	9	15991	15999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020549	A	6	6	16024	16029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020549	CA	3	6	16058	16063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020549	A	6	6	16063	16068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020549	A	6	6	17227	17232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020549	CAAC	2	8	17233	17240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020549	CTA	2	6	17241	17246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020549	TA	3	6	17245	17250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020549	AAAC	2	8	17251	17258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020549	AAT	3	9	17267	17275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020549	CAA	2	6	17853	17858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020549	A	7	7	18113	18119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020549	AAT	2	6	18159	18164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020549	CCG	2	6	18213	18218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_020549	AT	3	6	18266	18271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020549	TTA	2	6	18276	18281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020549	TC	3	6	19484	19489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020549	TC	3	6	19493	19498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020549	AATA	2	8	19505	19512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020549	AGG	2	6	19534	19539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020549	A	8	8	19635	19642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020549	ATA	2	6	19654	19659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020549	ATG	2	6	19696	19701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020549	ATG	2	6	19722	19727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020549	AC	3	6	21001	21006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020549	ATCA	2	8	21042	21049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020549	TTGA	2	8	21162	21169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020549	CAA	2	6	21225	21230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020549	TAA	2	6	21315	21320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020549	CACT	2	8	21369	21376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020549	AT	3	6	21395	21400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020549	TAA	2	6	21462	21467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020549	ATA	2	6	21479	21484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020549	CA	3	6	21500	21505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020549	CAG	2	6	21555	21560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020549	CAT	2	6	21567	21572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020549	AT	3	6	21571	21576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020549	AAC	2	6	21621	21626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020549	CTT	2	6	21669	21674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020549	ATA	2	6	21683	21688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020549	AAT	2	6	21726	21731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020549	A	6	6	21807	21812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020549	TCA	2	6	21920	21925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020549	CCA	2	6	21932	21937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_020549	TAA	2	6	21948	21953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020549	AC	4	8	21955	21962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020549	T	6	6	22001	22006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020549	TGA	2	6	22035	22040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020549	A	6	6	22112	22117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020549	AGA	2	6	22164	22169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020549	CAT	2	6	22467	22472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020549	TCA	2	6	22579	22584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020549	ATG	2	6	22607	22612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020549	TCA	2	6	22624	22629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020549	A	6	6	23814	23819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020549	TTA	2	6	23835	23840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020549	AAAAAG	2	12	23855	23866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020549	A	6	6	23882	23887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020549	A	6	6	23915	23920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020549	TAT	2	6	23928	23933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020549	CTA	2	6	23938	23943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020549	ATA	2	6	23961	23966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020549	AAGC	2	8	23985	23992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020549	TAG	2	6	24006	24011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020549	ATG	2	6	24300	24305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020549	TAA	2	6	24315	24320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020549	AGT	2	6	24351	24356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020549	AGAA	2	8	24386	24393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020549	TCT	3	9	24432	24440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_020549	ATAA	2	8	24478	24485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020549	TACA	2	8	24488	24495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_020549	CTG	2	6	24606	24611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_020549	CAT	2	6	24684	24689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_020549	TGA	2	6	25554	25559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_020549	AG	3	6	25598	25603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020549	CTA	2	6	25612	25617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_020549	CAA	2	6	25720	25725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_020549	CAA	2	6	25787	25792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_020549	ATA	2	6	25819	25824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_020549	T	6	6	27825	27830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_020549	A	8	8	28528	28535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_020549	A	7	7	28706	28712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020549	A	7	7	28728	28734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_020549	TAA	2	6	28798	28803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_020549	AT	4	8	28804	28811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_020549	ATT	2	6	44471	44476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_020549	TCT	2	6	44595	44600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_020549	T	6	6	47949	47954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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